Расположение файла persistence.xml должно соответствовать спецификации

Единица хранения JPA определяется файлом persistence.xml. Файл persistence.xml должен находиться в каталоге META-INF корня единицы хранения, как определено спецификацией JPA.

Это правило содержит автоматическое исправление для перемещения файла persistence.xml . Скопируйте пользовательскую конфигурацию в файл компоновки приложения, чтобы включить его.

Дополнительная информация о компоненте JPA приведена в спецификации JPA 2.1.